Về công nghệ NANO - Hospital 2016 phát huy triệt để lợi thế của mô hình MVC giúp phần mềm có thể chạy tốt trên đa nền tảng với hiệu năng rất cao. Hệ thống có thể vừa chạy trên web lẫn winform, giúp giải quyết đa dạng các bài toán cho các mô hình bệnh viện như: Giải pháp cho các bệnh viện lớn, giải pháp cho mô hình chuỗi bệnh viện với cơ sở dữ liệu tập trung hay vừa tập trung vừa phân tán… Tốc độ xử lý cũng được cải tiến rõ rệt. Việc truy xuất các báo cáo, thống kê cũng trở nên nhanh chóng và dễ dàng hơn bao giờ hết.
Phần mềm quản lý bệnh viện NANO - Hospital 2016 cũng đánh dấu việc áp dụng triệt để các chuẩn thông tin trong y tế theo quy định tại thông tư số 53/2014/TT-BYT ban hành ngày 29/12/2014 về quy định điều kiện hoạt động y tế trên môi trường mạng như HL7, DICOM…. Ngoài ra hệ thống đã được chuẩn hóa theo công văn 9324/BYT-BH của Bộ y tế ban hành ngày 30/11/2015. Đây là công văn quy định về trích xuất đầu ra dữ liệu yêu cầu thanh toán BHYT nhằm mục đích bảo đảm thống nhất trên toàn quốc.
Ngoài ra, năm 2016 Nanosoft đã phát triển riêng biệt một số phiên bản cho các bệnh viện đặc thù như: phiên bản dành riêng cho khôi các bệnh viện Quân y, phiên bản cho các bệnh viện trực thuộc Bộ công an, phiên bản dành riêng cho Y học cổ truyền...